1月

12日  西安医科大学党委常委会决定:任命杨世兴、张悦明为二附院党委副书记。免去庄林二附院党委副书记职务。

15日西安医科大学党委常委会议决定，任命陈君长为二附院代院长，医学二系代系主任。

19日  西安医科大学党委常委扩大会决定，二院党政分工:陈君长领导全面行政工作，周育民负责医疗工作，叶复来负责教学、科研，姚凯南负责防保、家床、计生、图书，张福海负责后勤总务，杨世兴负责党委全面工作，张悦明负责工会、团委、学生。

19日  医院党委常委会决定：任逯德位为党委办公室主任，免去张悦明党委办公室主任职务。

21日  西安医科大学党委常委会决定，任命杨世兴为二附院党委常委；免去陈松旺党委常委职务；免去陈君长代书记职务。

2月

26日  院党委常委会议决定:任安九令为医疗科科长，王法武为总务科科长，王炜为电教中心主任，王振元为院长办公室副主任，黄沐生为电教室副主任。免去董正轩医疗科长职务，免去刘福林人事科科长职务，免去王明学院长办公室主任职务，免去刘海云人事科副科长职务，免去齐乃新院长办公室副主任职务，免去赵龙柱医疗科副科长职务。

3月

医院1988年申报29项“卫生部重点科研课题”和13项国家自然科学基金。

3日  院党委常委会议决定:成立医院管理研究室，由陈君长兼任主任。

29日  医院成立综合档案室，隶属院长办公室领导。

29日  根据中央关于政治体制改革和党的职能分开的要求，院党委常委(扩大)会议研究，认为医院实行院长负责制的条件基本成熟，并向校部党委上报《关于西安医科大学第二附属医院实行院长负责制的请示报告》。

30日  卢希谦向校党委委员、各大单位负责干部宣读了卫生部党组关于西安医科大学党委常委的组成。同意西安医科大学第五次党代会选举结果，同意卢希谦、任惠民、张靖寰、陈君长、高福庆、石大璞6人组成常委会。卢希谦任党委书记、陈君长任党委常务副书记。

4月

西安医科大学党委常委会研究决定，在原“骨病研究室”的基础上成立“西安医科大学地方性骨病研究所”。同时任命殷培璞为所长，莫东旭、陈君长(兼)为副所长，张矢运、上官存民为秘书。

4-11月  张爱宏教授在美国费城托马斯•杰弗逊大学医院超声诊断科进修学习，期间应邀参加了三次会议:5月4-7日在美国大西洋城举行的全面超声医学进展会议；10月5-17日在美国华盛顿举行的世界超声医学历史会议；10月17-21日在美国华盛顿举行的世界超声医学及生物学联合会学术会议。在世界超声医学会议上，张爱宏教授被授予由世界超声医学院及生物学联合会主席H•Ethompson教授、世界超声医学及生物学联合会档案委员会主席B•B•Goldbzq教授等联合签署颁发的“超声医学先驱工作者”光荣称号。 

15-16日 二附院体育代表队在西安医科大学二十一届田径运动会中获得精神文明奖第一名。

19日  医院办公会决定，在门诊设置“意见箱”接受群众监督与批评。

29日  医院职工乒乓球队在西安医科大学首届教职工乒乓球赛中取得了男子团体冠军、女子团体亚军的优异成绩。

5月

4日  院党委常委会议决定、并经5月17日西安医科大学校长办公会议批准，成立房产科。任命郇宜让、党永贞为房产科副科长，免去郇宜让总务科副科长职务。任任根喜为财务科科长兼改革办主任，赵连清为营养科科长，苏龙为审计科科长，免去其纪检员(副科级)职务。任曹阳为人事科副科长，田龙旺为出入院管理科副科长。免去薛桂馥审计科科长职务，免去李长安设备科副科长职务。

4日  院党委常委会决定，成立干部病房管理办公室。刘文超为主任，国冬考、林祖粤为副主任。

5日  院党委向西安医科大学党委上报《关于成立西安医科大学第二附属医院院务委员会的报告》，拟订医院院务委员会的组成为:主任委员:陈君长。委员12人。

7日  医院评选优秀护士39名，在护士节时给予表彰。内科护士杜秀珍代表学校及陕西省参加全国模范护士评选。12日，杜秀珍被卫生部授予“模范护士”称号。

10日  医院第三批支援吴旗医疗队赴陕北吴旗县进行扶贫医疗。

12-18日  樊玉林教授应日本奈良市耳鼻喉学会邀请，随西安市访日医师团赴日本奈良访问，参观奈良市医大、大阪府成人病院及大阪大学医学院耳鼻喉科，受到奈良市市长的接见。

18日-7月1日，院党委举办第三期业余党校，109名积极分子参加。

6月

8日  西安医科大学党委常委会通过1987年端正党风先进集体、先进个人。二附院内科、中医科、妇产科、儿科支部获先进集体，有7人获先进个人。

15日  《陕西日报》刊登了第医院第三批赴陕北老区吴旗县医疗队工作组照片，并表扬医疗队医疗水平高，服务热情，受到了当地群众的赞誉。

20日  根据西安医科大学科字第018号文，二附院成立行为及发育儿科学研究室。

7月

15日  皮肤科与新城区痔瘘医院联合创办的皮肤科专科医院开诊。

16日  内科、普外科与灞桥区医院联合创办的二附院第三分院开诊。

18日  陕西省卫生厅关于成立《西安医科大学第二附属医院眼、耳鼻喉专科医院》的批复”。同意医院与中国人民解放军第三十五医院合作，成立西安医科大学第二附属医院眼、耳鼻喉专科医院，设置病床120张及眼、耳鼻喉、皮肤科门诊。

21日  任白肇中为院改革办公室副主任。

30日  根据卫生部等上级单位(88)卫字第23号《严禁废弃的一次性医疗器具流入市场的紧急通知》精神，医院对一次性医疗器具管理做了详细的规定，明确了职责，加强了环节管理。

8月

13日  临床药理研究室开展高效液相色谱分析。

22日  经卫生部卫计字第119号文件批准，医院外科大楼即将破土动工。院领导召开有关科室负责人会议，研究施工前拆迁等准备工作。

25日  院党委(扩大)会决定成立医院“基建领导小组”，组长:陈君长；副组长:张福海、周育民；成员单位:基建科、总务科、房产科、审计科、保卫科；日常工作由基建科负责，基建科由张福海负责。

25日  院党委常委会(扩大)决定:任命董正轩、张全忠(兼)为眼耳鼻喉专科医院副院长。

9月

1日  根据国家卫生部卫计字(87)189号文件《关于彻底执行国务院税收、财务、物价大检查的通知》精神。院长办公会决定由财务科、审计科、出入院管理科、党办组成5人检查小组，对医院财经纪律和收费工作进行认真检查。

1日  医院开始安装自动电话。加强医院管理工作现代化，促进医疗、教学、科研事业发展。

13日  院长办公会议决定，调整医院医疗事故鉴定委员会人员组成。新的医疗事故鉴定委员会人员组成为:主任委员赵子慎，副主任委员秦兆寅，委员7人。

24日  儿科采用氰化高铁法、721分光光度计比色，开展血清铁蛋白、红细胞游离原叶啉等早期诊断缺铁性贫血的化验项目。

28日  院长办公会决定，成立内科三病区(综合病房)，缓解内科住院难的矛盾。

本月  邓云山教授随中国麻风病协会代表团前往荷兰参加第十三届国际麻风病学大会。

10月

7日  医院增开的闭路电视系统正式播放。

8日  医院第二批医疗队被延安地区行政专署评为“先进医疗队”，并授予“支援延安，成绩卓著”锦旗，为医院赢得荣誉。

27日  院长办公会决定，成立医院“税收、财务、物价大检查领导小组”，组长陈君长，副组长任根喜、苏龙。领导小组办公室设在审计科。

11月

15日  主任医师陈君长设计研制的“头颈椎运动域测定仪”荣获1988年度国家发明四等奖。这是医院也是西安医科大学首次获国家发明奖。

17日  院长办公会决定，成立医院劳动鉴定委员会。主任：周育民，副主任：赵子慎、万恒麟，委员七人。主要任务为负责解决本院职工疑难病的诊断处理；决定本院职工特殊病的病休问题；提出转院外地诊疗意见，必要时要求有关科主任参加；对长期病休职工定期组织复查，并提出诊断处理及休假和工作意见。

17日  院党委常委会议决定，任王生元为伙食科科长，陈惠中为防保科副科长。

12月

1日  院党委常委会议决定，任命杨德昌为内科学教研室主任；孙济川、罗金燕为内科学教研室副主任。同日决定，成立医院理论学习中心组，每月定期进行政治座谈学习。组长：陈君长，副组长：杨世兴、张悦明，成员8人。

13日  经西安医科大学党委第十九次常委会议决定:张悦明任附属口腔医院党总支副书记，免去其第二附属医院党委副书记职务。

28日  医院举办十一届三中全会以来十年成就展览，内容概括地反映了医院十年来各方面特别是1988年以来改革总揽全局所取得的成绩与变化，此次共展出32块版面。

本年  应国际儿童保健部主任Hoffvander教授的邀请，姚凯南教授受卫生部妇幼司派遣，并任副团长，率中国儿童保健部，赴瑞典乌普萨拉大学国际儿童保健部访问。期间，参加了两次国际讲习班，访问了当地的各级儿保机构。

本年  医院共获各类科研成果奖多项，其中国家科委国家级重大科技成果奖1项、国家自然科学发明奖1项、卫生部科技成果奖1项、陕西省科技进步三等奖5项、获陕西省中医药科技成果奖3项，获科研协作成果奖3项；获省卫生厅科技成果奖2项；获首届全国“百病克星”产品大奖赛金质、银质奖各1项；获全国“健康杯赛”银质奖1项。

本年  医院评出优秀党支部书记8人，先进科室14个，先进个人81人。院党委对18个支部进行调整(全院共29个支部)。急诊科调整病房，增设分诊台。医院试行承包责任制，放射科率先起步承包，放开拍片；全院党员435名，共发展新党员22名，预备转正24名。

本年  医院业务收入突破千万元大关。

本年 医院被评为“全省文明建设先进集休”。刘冠东被评为“全国精神文明先进个人”。

本年  医院开设小儿科行为疾病门诊。

本年  骨科教授陈君长、普外科教授刘效恭被授予“卫生部有突出贡献专家”称号。

自1985年，医院受卫生部、省卫生厅委托，接受各类医学培训及进修1112人，派出专业人员出国和兄弟院校进修学习，引进世界各地医学专家进行广泛医学交流；对175名护士进行脱产轮训，全部达到中专水平；对70名护师(含药剂师、技师)进行英语脱产班学习，考取省内各类五大生111人，已有9人取得本专科毕业证书；劳司创办的职校共培养学员197人；178人参加院业余党校学习并取得结业证书。在全省成人教育会议上医院被授予“全省成人医学教育先进集体”受到表彰。